Встречалось и такое, причем границы лицензий несколько отличались. Лицензия НЭ на вышележащие, а лицензия НП на нижележащие пласты.

Да, конечно есть, это как правило, горные отводы выше (по НР и НЭ) для разведки и добычи, а ниже - геологические (НП) для поисков.

если у вас лицензия НР, то никакая лицензия НП вам не нужна.

Если же у вас лицензия НЭ с ограничением по глубине (многие недропользователи при "амнистии" 2016 года сделали себе горные отводы практически без ограничений), то для поиска в нижележащих отложениях оформляется лицензия НП.

Также теперь можно по заявительному принципу получить лицензию НП на "фланги" - примыкающие непосредственно к вашему лицензионному участку территории, которые не имеют открытых запасов и локализованных ресурсов.

ограничением такого права является соседство с другими недропользователями. если "фланг" находится на расстоянии менее 20 км от стороннего недропользователя, то необходимо получить согласие на лицензирование вами фланга. Если согласия не будет, то участок подается на конкурс и далее по стандартной схеме...