По первой части вопроса: все зависит от того, какие изменения будут вноситься. Так при добавлении разлома, можно перестроить частично модель (по определенному сектору). кроме того, есть такая функция как воркфлоу (граф моделирования), которая позволяет в автоматическом режиме повторить выделенные пользователем последовательность операций.

Вторая часть: мониторинг- это "локальное" перестроение модели. На этапе, когда уже есть готовая модель и появляется новая информация противоречущая действующей модели (данные по бурению новых скважин), то необходимо обновлять модель (как 2Д так и 3Д). Это процесс созднаия так называемой постоянно-действующей модели. Граница мониторинга и полного перестроения- когда локальных блоков перестроения становиться слишком много (к примеру добавилось большое количество скважин на разных участках месторождения), то становиться проблематичным перестраивать модель секторно. В этом случаи модель перестраивают полностью.