Эффективность работы измеряется стандартно по метрикам. В нашей компании эффективность отдельно взятого сотрудника складывается из трех показателей - метрики по компании, бизнес единице и результатов выполнения целей поставленных на год. Каждый из трех полученных показателей имеет вес 1/3 и используется для расчета бонуса.

Это КПЭ что ли?

Нет -это КТУ. Коэффициент Трудового Участия-расчитывается из :
а)жадности хозяина  
б)хотелок руководителя, 
в)успешности выполнения или не выполнения задания поделенное на обстоятельства или условия

Да вообще странно как-то звучит. Из формулировки, которую ты указал в самом начале, следует, что ты должен обосновать, что не зря ЗП получаешь. Точнее, что отдел разработки существует не зря. Вопросы конечно хорошие, но задаваться ими должные руководители компании, которые вместе с HR создавали структуру, определялись с количеством сотрудников и их обязанностями. А затем мониторить эффективность работы компании, эффективность взимодействия между отделами, ну и прочее... Ладно не буду разглагольствоваться.

В общем, твоя личная обязанность, как работника отдела или его руководителя заключается в постановке целей/задач на год (руководитель соотвественно помимо личных задач, определяет задачи всего отдела в целом), мониторинге выполнения задач, а затем в конце года в итоговом анализе того, что и как было сделано, лучше/хуже чем планировали, какие проекты успели сделать или нет и пр. Исходя из этого надо поставить оценку. 

Остальные метрики определяются для всей компании в целом и для актива. 
Общие метрики типичны для многих компаний:
- чистая прибыль
- годовая добыча
- операционные затраты
- куча метрик по безопасности
- ...
-