Да можете его спускать куда угодно, при двух не изолированных технически интервалах (отсутствие пакера между объектами при замерах), прибор вам покажет некоторое среднее давление для двух интервалов. Если они ранее не разрабатывались, то сможете по весу столба жидкости и замеру на определенной глубине пересчитать замер на верхние дыры ИП каждого из них. Если интервалы длительное время находились в разработке, то общее давление будет тяготеть к тому интервалу у которого давление больше.

Вообще есть такая фишка, называется Multylayer testing (разновидность PLT). 

Касательно вашего случая- мерять на кровле ИП или на середине ИП (как у нас принято), смотря чем скважина заполнена и что в пласте.

Если два разных горизонта с разными пластовым давлениями перфорированы в одной скважине, будет переток флюида из области высокого давления в область низкого, и, как следствие, ничего хорошего.

Геолог-разработчик пишет:

 kochichiro, оба интервала не изолированы. Получается можно спускать манометр между двумя перфорированными интервалами напротив непростреленного интервала?

А если два разных горизонта перфорированы в одной и той же скважине?

и что значит аббревиатура ИП?

Спускать прибор придется скорее всего чуть выше башмака нкт, чтобы потом при подъеме не оборвать. С пластами фишка такая как я уже сказал - если давление одинаковое, что бывает обычно в начале разработки, то из любой точки замера по ро ж аш вы пересчитаете давление на верхние дыры интервала перфорации каждого из пластов/прослоев. Если уже давление разное и стоит задача оценить его в каждом пласте/прослое, то тут надо производить индивидуальный замер с пакеровкой каждого из интервалов. У шлюмов для этих целей есть такая штука - CHDT, есть ли у нас аналог такой - не знаю.